A

$A$、摩擦起电的实质是电子的转移，是电子从一个物体转移到另一个物体上，并没有产生电荷，与玻璃棒摩擦过的丝绸带负电。故$A$错误；
$B$、谱线“红移”现象说明星系在逐渐远离我们，故$B$正确；
$C$、汤姆生发现了比原子小得多的带负电荷的电子，从而说明原子是可分的，故$C$正确；
$D$、质子和中子构成原子核，电子和原子核构成原子，原子构成分子，分子构成物质，所以它们从大到小的顺序为：宇宙、太阳系、地球、分子、质子、电子，故$D$正确。
故选：$A$。