C

$A$、由于病毒分子的体积很小，只有借助电子显微镜才能看到，故$A$错误；
$B$、分子很小，直接用肉眼看不到，飞沫是肉眼可以看到的，所以病毒随飞沬传播是机械运动，不是分子的运动，故$B$错误；
$C$、病毒由分子构成，且这些分子之间有引力也有斥力，故$C$正确；
$D$、由分子动理论可知分子之间存在间隙，所以口罩材料分子之间也有空隙，故$D$错误。
故选：$C$。