$\left(1\right)0.9kg$的氢燃料完全燃烧放出的热量：
$Q_{放}=mq_{氢}=0.9kg\times 1.4\times 10^{8}J/kg=1.26\times 10^{8}J$；
$(2)$由题意可知水吸收的热量：$Q_{吸}=Q_{放}=1.28\times 10^{8}J$，
由$Q_{吸}=cm\Delta t$得水的质量：$m_{水}=\frac{{Q}_{吸}}{{c}_{水}Δt}=\frac{1.26×1{0}^{8}J}{4.2×1{0}^{3}J/(kg•℃)×(50℃-20℃)}=1000kg$；
$(3)$公交车的功率为$P=1.4\times 10^{5}W$，做功时间$t=9\min =540s$，
根据$P=\frac{W}{t}$得公交车所做的功为：
$W=Pt=1.4\times 10^{5}W\times 540s=7.56\times 10^{7}J$，
氢燃料公交车的效率为：$\eta =\frac{W}{{Q}_{放}}\times 100\%=\frac{7.56×1{0}^{7}J}{1.26×1{0}^{8}J}\times 100\%=60\%$。
答：（1）质量为$0.9kg$的氢燃料完全燃烧放出的热量是$1.26\times 10^{8}J$；
$(2)$若放出的热量全部被初温为$20^{\circ}\mathrm{C}$的水吸收后，水的温度升高到$50^{\circ}\mathrm{C}$，则水质量是$1000kg$；
$(3)$若放出的热量可以使恒定功率为$1.4\times 10^{5}W$的公交车匀速行驶$9$分钟，则氢燃料公交车的效率为$60\%$。

$\left(1\right)0.9kg$的氢燃料完全燃烧放出的热量：
$Q_{放}=mq_{氢}=0.9kg\times 1.4\times 10^{8}J/kg=1.26\times 10^{8}J$；
$(2)$由题意可知水吸收的热量：$Q_{吸}=Q_{放}=1.28\times 10^{8}J$，
由$Q_{吸}=cm\Delta t$得水的质量：$m_{水}=\frac{{Q}_{吸}}{{c}_{水}Δt}=\frac{1.26×1{0}^{8}J}{4.2×1{0}^{3}J/(kg•℃)×(50℃-20℃)}=1000kg$；
$(3)$公交车的功率为$P=1.4\times 10^{5}W$，做功时间$t=9\min =540s$，
根据$P=\frac{W}{t}$得公交车所做的功为：
$W=Pt=1.4\times 10^{5}W\times 540s=7.56\times 10^{7}J$，
氢燃料公交车的效率为：$\eta =\frac{W}{{Q}_{放}}\times 100\%=\frac{7.56×1{0}^{7}J}{1.26×1{0}^{8}J}\times 100\%=60\%$。
答：（1）质量为$0.9kg$的氢燃料完全燃烧放出的热量是$1.26\times 10^{8}J$；
$(2)$若放出的热量全部被初温为$20^{\circ}\mathrm{C}$的水吸收后，水的温度升高到$50^{\circ}\mathrm{C}$，则水质量是$1000kg$；
$(3)$若放出的热量可以使恒定功率为$1.4\times 10^{5}W$的公交车匀速行驶$9$分钟，则氢燃料公交车的效率为$60\%$。