D

$A$、该化合物是氨气，不含有碳元素，不属于有机物，故$A$错；
$B$、该物质是二氧化碳，虽然含有碳元素，但是性质与无机物相似，属于无机物，故$B$错；
$C$、该物质是碳酸，虽然含有碳元素，但是性质与无机物相似，属于无机物，故$C$错；
$D$、该物质是甲烷，属于有机物，故$D$正确。
故选：$D$。