（1）变化①是化学变化，反应前后分子种类发生改变，所以分子本身发生改变的是变化①；
$(2)$由图示可知：化学变化中最小的微观粒子是原子；
$(3)$变化②、③的微观实质是分子的间隔改变；
$(4)$氢气和氯气都是由分子构成的。
故答案为：（1）①；
$(2)$原子；
$(3)$间隔；
$(4)$分子。

（1）变化①是化学变化，反应前后分子种类发生改变，所以分子本身发生改变的是变化①；
$(2)$由图示可知：化学变化中最小的微观粒子是原子；
$(3)$变化②、③的微观实质是分子的间隔改变；
$(4)$氢气和氯气都是由分子构成的。
故答案为：（1）①；
$(2)$原子；
$(3)$间隔；
$(4)$分子。